2130年，受第三次世界大战的影响，日本各地均出现了被称为「BS（Black Spot）」的巨大污染区域。「BS」被作为废墟用巨大墙壁隔离，然而不久，这荒芜的大地出现了居民。他们被住在「城市（City）」里的人称为「无用者（Needless）」，而当中也有特殊能力者存在。 故事的开端是名为库鲁斯·西尔特的少年，他与他的姐姐亚路佳·西尔特所属的反抗组织的目标是从西美翁的暴力统治中解放「BS」。在一次埋伏亚当·阿库莱特的战斗中反抗组织被反埋伏且被全数攻破，在逃亡过程中库鲁斯的姐姐因保护弟弟不幸阵亡，库鲁斯只身一人逃进地下水道。眼看追兵将至，已放弃希望的库鲁斯遇到了与阿库莱特相貌及其相似的亚当·布雷特，後者将他救出，後库鲁斯和布雷特後来来到了教会，并且遇见了众多同伴，以此为契机，库鲁斯开始了在教会的生活和战斗。
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